Bacteriología y Micobacterias

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La Unidad de Bacteriología y Micobacterias de la CIB es un grupo de investigación reconocido como categoría A por Colciencias. Tiene una trayectoria de 30 años desde su creación en la Corporación para Investigaciones Biológicas y es avalado por la Universidad Pontificia Bolivariana.

Sus actividades están enfocadas en investigación básica y aplicada en relación a tuberculosis y micobacteriosis, con énfasis en el estudio del bacilo tuberculoso, su transmisión, su relación con el hospedero y su capacidad de generar resistencia a medicamentos. Desarrolla actividades adicionales relacionadas con la investigación como el diagnóstico de tuberculosis y micobacteriosis y la formación de estudiantes de pregrado y postgrado.

Tiene capacidades de infraestructura y tecnológicas como un laboratorio con nivel 3 de bioseguridad para el cultivo, aislamiento e identificación de micobacterias y una colección de aislamientos clasificados de Mycobacterium tuberculosis y otras especies de micobacterias (7000 aislamientos). Además, tiene un laboratorio de nivel 2 de bioseguridad donde se realizan procesos de biología molecular y aislamiento y purificación de ácidos nucleicos con capacidades para secuenciación de genomas e infraestructura computacional para análisis bioinformáticos.
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[av_tab title=’Equipo
científico‘ icon_select=’no’ icon=’ue800′ font=’entypo-fontello’ custom_id=» av_uid=’av-7a362′]


Jaime Alberto Robledo Restrepo
Líder de unidad
jrobledo@cib.org.co
Teresa Realpe Quintero
Investigadora
trealpe@cib.org.co
Nataly Álvarez Zuluaga
Investigadora
nalvarez@cib.org.co


Luz Elena Botero
Investigadora
luzelenabp@yahoo.com
Gloria Isabel Mejía
Investigadora
gloriaisamejia@gmail.com
Uriel Alonso Hurtado Páez
Investigador
uhurtado@cib.org.co

Dione Benjumea Bedoya
Investigador
dbenjumea@cib.org.co
Jeannette Mosquera
Estudiante
jmosquera@cib.org.co
Mónica Maria Gómez Mósquera
Estudiante
mgomez@cib.org.co

Daniela Martinez Peñaloza
Médico general
dmartinez@cib.org.co
Lisandra Maria García Arango
Auxiliar de enfermería
larango@cib.org.co
Maria Yesenia Perea Torres
Gésis
mperea@cib.org.co

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investigación‘ icon_select=’no’ icon=’ue800′ font=’entypo-fontello’ custom_id=»]

Epidemiología y mecanismos de resistencia a antibióticos y medicamentos antituberculosos

Estudia los mecanismos de resistencia a antibióticos en bacterias y en Mycobacterium tuberculosis y otras especies de micobacterias que causan infecciones en humanos. Se realizan proyectos para determinar las dinámicas de distribución y transmisión en la población. Esta información permite entender este problema y ayuda en la formulación de medias de control en el país.

Evaluación y desarrollo de nuevas alternativas para el diagnóstico de tuberculosis y pruebas de sensibilidad a medicamentos antituberculosos

La línea tiene como objetivo desarrollar, evaluar o adaptar estrategias de diagnóstico microbiológico de tuberculosis, con énfasis en técnicas más rápidas y precisas que permitan su fácil implementación por los programas de control de tuberculosis. Particularmente uno de los intereses en este campo radica en llevar las evaluaciones desde el diseño y evaluación en el laboratorio hasta su implementación en los programas de control de tuberculosis.

Genómica y metabolómica de M. tuberculosis aplicadas a la búsqueda de blancos metabólicos para el diseño de nuevos medicamentos antituberculosos y nuevos métodos diagnósticos

Esta línea está dirigida a entender mejor las diferentes vías metabólicas del bacilo tuberculoso desde el punto de vista metabólico y genético, con el fin de utilizar este conocimiento para el desarrollo de nuevos medicamentos activos contra el bacilo, el diseño de nuevos métodos diagnósticos y entender los procesos de infección relacionados con la información genómica del bacilo.

Genotipificación y filogenética de M. tuberculosis

Desarrollar y evaluar herramientas para genotipificación que tengan aplicación en epidemiología molecular y transmisión de tuberculosis en una población. Además utilizar estas herramientas para definir dinámicas filogenéticas de las poblaciones de M. tuberculosis y su relación con las poblaciones humanas.

Relación hospedero-patógeno en micobacterias

Esta línea tiene como objetivo Determinar los factores implicados en la relación hospedero-microorganismo en tuberculosis con énfasis en factores que dependan del microorganismo y susceptibilidad del hospedero.

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[av_tab title=’Proyectos
bacteriología‘ icon_select=’no’ icon=’ue800′ font=’entypo-fontello’ custom_id=»]

En ejecución

  • Contribución de las ADN metiltransferasas como mecanismo epigenético en el desarrollo de resistencia a fármacos antituberculosos (Convocatoria Colciencias 807, 2018) CIB, UPB co-ejecutor.
    Investigador principal: Nataly Alvarez.
  • Redefiniendo la resistencia en pruebas de susceptibilidad a medicamentos antituberculosos utilizados para el tratamiento de tuberculosis multi-resistente (Convocatoria Colciencias 896-2018) CIB, en asocio con C. Koser afiliado con U. Cambridge, UPB co-ejecutor.
    Investigador principal: Nataly Alvarez.
  • Plataforma basada en biosensores a fibra óptica para la detección rápida de tuberculosis y el seguimiento evolutivo de pacientes
    (convocatoria Colciencias 807-2018). Universidad Nacional, Universidad EIA co-ejecutor, CIB co-ejecutor.
    Investigador principal: Juan Fernando Botero (Universidad Nacional).
  • Atención de niños contacto de pacientes con tuberculosis pulmonar: contribución a la actualización de los lineamientos nacionales a partir de la evidencia internacional disponible y de la generación de nueva evidencia local (convocatoria Colciencias 842-2019) CIB, U. de Antioquia co-ejecutor, Corporación Universitaria Remington co-ejecutor, UPB co-ejecutor, Corpogen co-ejecutor.
    Investigador principal: Jaime Robledo.

Finalizados

Año 2019

  • Bombas de flujo y resistencia a medicamentos antituberculosos.(Convocatoria Colciencias 712-2015) en asocio con UPB.
    Investigador principal: Nataly Alvarez.
  • Tuberculosis Bovina en trabajadores expuestos a bovinos en fincas lecheras de Antioquia (convocatoria Colciencias).
    Investigador principal: Johana Rueda.

Año 2018

  • Determinación de un «core» genético de Mycobacterium tuberculosis mediante tecnologías de alto rendimiento con aplicabilidad en la identificación de potenciales biomarcadores de la interacción patógeno-hospedero (convocatoria Colciencias 576-2012) Corpogen, U. Nacional co-ejecutor, Cidet co-ejecutor, CIB co-ejecutor.
    Investigador principal: Patricia del Portillo (Corpogen).
  • Desarrollo del prototipo “point-of-care” poc-tb para el diagnóstico de tuberculosis activa (convocatoria Colciencias 700 del 2014). Corpogen, CIB co-ejecutor.
    Investigador principal: Patricia del Portillo (Corpogen).
  • Estudio de factores relacionados con la efectividad del tratamiento para infección latente por tuberculosis en niños menores de cinco años convivientesde pacientes con tuberculosis pulmonar de Medellín, 2014-2016. (convocatoria Colciencias  657 del 2014) Universidad de Antioquia, CIB co-ejecutor.
    Investigador principal: María Patricia Arbeláez Montoya (Universidad de Antioquia).

Año 2017

  • Estudio de los pigmentos carotenoides y su papel en la biología de micobacterias de interés clínico (Convocatoria 658 Colciencias del 2014). CIB.
    Investigador principal: Luz Elena Botero.

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cooperación‘ icon_select=’no’ icon=’ue800′ font=’entypo-fontello’ custom_id=»]

Internacionales

  1. Jose Luis Gomez, Yale University, Boston
  2. Claudio Koser, Cambridge University-Organización Mundial de la Salud
  3. Hachim Hoerauf, Bonn University, German Center for Infectious Diseases Research

Nacionales

  1. Red de vigilancia de Resistencia a Antibióticos en Medellín y área Metropolitana GERMEN
  2. Patricia del Portillo, CORPOGEN
  3. Universidad de Antioquia, María Patricia Arbelaez
  4. Corporación Universitaria Remington
  5. Universidad Nacional, sede Medellín
  6. Universidad EIA, Yeison Montagut

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bacteriología‘ icon_select=’no’ icon=’ue800′ font=’entypo-fontello’ custom_id=’#publicaciones_tab_salud’ av_uid=’av-9h1re’]
Año 2019

  • Sierra E, Maldonado N, Arroyave B, Robledo C, Robledo J. Identificación directa de microorganismos a partir de muestras de orina y hemocultivos utilizando MALDI-TOF. Infectio 2019; DOI: 10.22354/in.v23i4.812
  • Robledo J.  Control de la tuberculosis multirresistente a fármacos: un objetivo posible. Biomédica. 2019;39:431-33.
  • Solano JS, Pino C, Robledo J. Toxin-antitoxin systems shows variability among Mycobacterium tuberculosis lineages. FEMS Microbiol Lett. 2019 Jan 1;366(1). doi: 10.1093/femsle/fny276.

Año 2018

  • Montaño A, Arroyave B, Maldonado N, Robledo C, Robledo J. Relación entre el volumen de muestra y la recuperación de bacterias a partir de hemocultivos: un estudio descriptivo en un hospital de Medellín, Colombia. Hechos Microbiológicos 2018;9(1-2):12-19.
  • Hernández Sarmiento, JM, Andrade, H, Murillo, LE, Velásquez, L, Gómez Restrepo, AJ Robledo, J. Mortalidad por tuberculosis, estudio del registro en municipios del departamento del Chocó, Colombia, 2012. Enfermedades Infecciosas y Microbiología, vol. 38, núm. 2, abril-junio 2018.
  • Verónica J. Gómez-Tangarife, Alex J. Gómez-Restrepo, Jaime Robledo-Restrepo y José M. Hernández-Sarmiento. Resistencia a Medicamentos en Mycobacterium tuberculosis: contribución de mecanismos constitutivos y adquiridos. Rev. Salud Pública. 20 (4): 498-504, 2018.
  • Coll F, Phelan J, Hill-Cawthorne GA, Nair MB, Mallard K, Ali S, Abdallah AM, Alghamdi S, Alsomali M, Ahmed AO, Portelli S, Oppong Y, Alves A, Bessa TB, Campino S, Caws M, Chatterjee A, Crampin AC, Dheda K, Furnham N, Glynn JR, Grandjean L, Minh Ha D, Hasan R, Hasan Z, Hibberd ML, Joloba M, Jones-López EC, Matsumoto T, Miranda A, Moore DJ, Morcillo N, Panaiotov S, Parkhill J, Penha C, Perdigão J, Portugal I, Rchiad Z, Robledo J, Sheen P, Shesha NT, Sirgel FA, Sola C, Oliveira Sousa E, Streicher EM, Helden PV, Viveiros M, Warren RM, McNerney R, Pain A, Clark TG.  Genome-wide analysis of multi- and extensively drug-resistant Mycobacterium tuberculosis. Nat Genet.  2018 Feb;50(2):307-316.
  • Maldonado N, Robledo C, Robledo J. La espectrometría de masas MALDI-TOF en el laboratorio de microbiología clínica. Infectio 2018; 22(1): 35-45.
  • Maldonado N, Robledo C, Munera MI, Capataz-Tafur C, Roncancio G, Franco L, Nagles J, Gil J, Arenas P, Gaviria M, Figueroa-Echeverri M, Robledo J, Grupo GERMEN. Caracterización de los procedimientos para la realización de hemocultivos en pacientes adultos, en instituciones hospitalarias del Área Metropolitana del Valle de Aburrá. Infectio 2018; 22(1): 19-25.
  • Berrio I, Maldonado N, De Bedout C, Arango K, Cano LE, Valencia Y, Jimenez-Ortigosa C, Perlin DS, Gomez B, Riobledo C, Robledo J. Comparative study for 147 Candida spp. identification and echinocandins susceptibility in isolates obtained from blood cultures in 15 hospitals, Medellin, Colombia. Journal of Global Antimicrobial Resistance. 2018;13:254-260.

Año 2017

  • Nelson José Alvis, María de los Ángeles Carrasquilla, Verónica Jhajaira Gómez, Jaime Robledo, Nelson Rafael Alvis-Guzmán, José Mauricio Hernández. Precisión diagnóstica de tres tecnologías para detectar tuberculosis multi-drogo resistente. Una revisión sistemática. Biomedica 2017;37(3. Doi: http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v37i3.3437

  • Maldonado N, Castro B, Berrio I, Manjarrés M, Robledo C, Robledo J. Ertapenem resistance in 2 tertiary-care hospitals: Microbiology, epidemiology, and risk factors. Enferm Infecc Microbiol Clin. 2017;35(8):509–513.

  • Adebisi Ajileye, Nataly Alvarez, Matthias Merker, Timothy M. Walker, Suriya Akter, Kerstin Brown1, Danesh Moradigaravand, Thomas Schön, Sönke Andres, Viola Schleusener, Shaheed V. Omar, Francesc Coll, Hairong Huang, Roland Diel1, Nazir Ismail1, Julian Parkhill , Bouke C. de Jong, Tim E. A. Peto, Derrick W. Crook, Stefan Niemann, Jaime Robledo, E. Grace Smith, Sharon J. Peacock, Claudio U. Köser. Some synonymous and non-synonymous gyrA mutations in Mycobacterium tuberculosis lead to 3 systematic false-resistance results to fluoroquinolones with the Hain GenoType MTBDRsl assays. Antimicrob. Agents Chemother 2017. doi:10.1128/AAC.02169-16.

Año 2016

  • Cataño JC, Robledo J. 2016. Tuberculous lymphadenitis and parotitis. Microbiol Spectrum 4(5): TNMI7-0008-2016. doi:10.1128/microbiolspec.TNMI7-0008-2016.
  • Alvarez N, Haft D, Hurtado UA, Robledo J, Rouzaud F. Whole-Genome Sequencing of a Haarlem Extensively Drug-Resistant Mycobacterium tuberculosis Clinical Isolate from Medellín, Colombia.Genome Announc. 2016 Jun 16;4(3). pii: e00566-16. doi: 10.1128/genomeA.00566-16.

  • Alvarez, N, Haft D, Hurtado UA, Robledo J, Rouzaud F. Whole-Genome Sequence of a Beijing Extensively Drug-Resistant Mycobacterium tuberculosis Clinical Isolate from Buenaventura, Colombia. Genome Announc 2016;4:e01549-15.

  • Hurtado UA, Solano JS, Rodriguez A, Robledo J, Rouzaud F. Draft Genome Sequence of a Mycobacterium africanum Clinical Isolate from Antioquia, Colombia.Genome Announc. 2016 Jun 2;4(3). pii: e00486-16. doi: 10.1128/genomeA.00486-16.

  • Alvarez N, Haft D, Hurtado UA, Robledo J, Rouzaud F. Whole-Genome Sequencing of Two Latin American–Mediterranean Extensively Drug-Resistant Mycobacterium tuberculosis Clinical Isolates from Medellín, Colombia. Genome Announcements. 2016;4(2):e00192-16. doi:10.1128/genomeA.00192-16.

Año 2015

  • Jaramillo-Grajales M, Torres-Villa R, Elizabeth Pabón-Gelves E, Marín-Muñoz PA, Barrientos-Urdinola K, J. Montagut-Ferizzola Y, Robledo-Restrepo JA. Diagnóstico de tuberculosis: desde lo tradicional hasta el desarrollo actual. Medicina y Laboratorio 2015;21:311-332.
  • Robledo J. La eliminación futura de la tuberculosis. Medicina y Laboratorio 2015;21:309-310.
  • Robledo C, Maldonado N, Noreña MC, Figueroa N, Lopera JR, Harry E, Robledo J. determinación de los niveles de procalcitonina para el diagnóstico de la sepsis neonatal. Medicina y Laboratorio 2015;21:85-92.
  • Rueda J, Realpe T, Ferro BE, Mejia GI, Robledo J. Genotypic analysis of genes associated with resistance to ethionamide in multidrug resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolates. Antimicrobial Agents and Chemotherapy 2015;59(12):7805-10.
  • Rueda J, Realpe T, Mejía G, Zapata E, Robledo J. GenoType® MTBDRplus 1.0 para detección de resistencia cruzada entre isoniazida y etionamida en aislamientos de Mycobacterium tuberculosismultifármaco-resistente. Biomédica. 2015:35(4):541-548 .

  • Gómez V, Guzman A, Mejia GI, Caceres DH, Robledo J, Rouzaud F. Evaluation of Simple and Cost-Effective DNA Preparation and Subsequent PCR Amplification for Clinically Relevant Mycobacteria. British Journal of Medicine & Medical Research 2015;8(2):147-156.

  • Paula A. Marín, Luz E. Botero, Jaime A. Robledo, Ana M. Murillo, Robinson A. Torres, Yeison J. Montagut, Elizabeth Pabón,Marisol Jaramillo. Purificación del antígeno 38 kda de mycobacterium tuberculosis y su potencial uso en diagnóstico mediante inmunosensores piezoeléctricos. Acta Biológica Colombiana. 2015;20(1):129-139.

Año 2014

  • Robledo J. In memorian: Hugo Trujillo Soto, MD (1929-2014): editorial invitado. Infectio. 2014;18:129 doi: 10.1016/j.infect.2014.06.001.
  • Hernández JM, Martínez MA, Castrillón DM, Mejía SA, Mejía GI, Zapata EM, Rojas S, Marín AE, Robledo J. Agar de capa delgada: Una opción costo-efectiva para el diagnóstico rápido de tuberculosis multirresistente. Rev. Salud Pública. 2014;16(1):101-113.
  • Maldonado NA, Múnera MI, López JA, Sierra P, Robledo C, Robledo J, et al. Tendencias de la resistencia a antibióticos en Medellín y municipios del Área Metropolitana entre 2007-2012: resultados de seis años de vigilancia. Biomédica. 2014;34(3):433-446.
  • Botero LE, Delgado-Serrano L, Cepeda ML, Bustos JR, Anzola JM, Del Portillo P, Robledo J,Zambrano MM. Respiratory tract clinical sample selection for microbiota analysis in patients with pulmonary tuberculosis. Microbiome 2014,2:29 pp:1-7.
  • Realpe T, Correa N, Rozo JC, Ferro BE, Gomez V, Zapata E, Ribon W, Puerto G, Castro C, Nieto LM, Diaz ML, Rivera O, Couvin D, Rastogi N, Arbelaez MP, Robledo J. Population Structure among Mycobacterium tuberculosis Isolates from Pulmonary Tuberculosis Patients in Colombia. PlosOne 2014, DOI: 10.1371/journal.pone.0093848.
  • Natalia Andrea Maldonado, Luz Elena Cano, Catalina De Bedout, Carlos Alberto Arbeláez, Gustavo Roncancio, Ángela María Tabares, Carlos Gonzalo Robledo, Jaime Robledo. Association of clinical and demographic factors in invasive candidiasis caused by fluconazole-resistant Candida species: a study in 15 hospitals, Medellín, Colombia 2010–2011. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease  2014;79(2):280-6.
  • Ocampo AM, Vélez L, Robledo J, Natalia Jiménez JN. Cambios a través del tiempo en la distribución de los complejos clonales dominantes de Staphylococcus aureus resistente a meticilina en Medellín, Colombia. Biomedica 2014;34(Supl. 1) doi:http://dx.doi.org/10.7705/biomedica.v34i0.1657.
  • Hernández Sarmiento, JM, Restrepo NB, Mejía GI, Restrepo MA, Robledo J. Rapid diagnosis of pulmonary tuberculosis . Pan African Medical Journal, 2014 Jun 17;18:141  DOI: 10.11604/pamj.2014.18.141.2295.

Año 2013

  • Jaramillo M, Montagut YJ, Montoya A, Robledo J, Marin PA, Betancur J.E, Moreno, M.J, Pabón E, Torres, RA. Design of a piezoelectric immunosensor for tuberculosis biomarker detection. Pan American Health Care Exchanges, PAHCE 2013 DOI:10.1109/PAHCE.2013.6568332.
  • Maldonado N, Luna MA, Lopera V, Robledo J, Robledo C. Caracterización de los programas de prevención y control de infecciones en instituciones hospitalarias de Medellín – Colombia, 2011. Infectio 2013;17:136-145
  • Castrillón D.M., Mejía S.A., Hernández J.M., Robledo J. Pulmonary tuberculosis in a 4-month-old twin: hereditary versus environmental factors. Int J Tuberc Lung Dis. 2013;17(6):848-849.
  • Hernández Sarmiento JM, Correa N, Correa M, Franco JG, Alvarez M, Ramírez C, Gómez LM, Toro AC, Londoño NH, Martínez M, Restrepo MA, Zapata E, Mejía GI, Robledo J. Tuberculosis Among Homeless Population from Medellín, Colombia: Associated Mental Disorders and Socio-Demographic Characteristics. Journal of Immigrant and Minority Health. 2013 Aug;15(4):693-9.
  • José Mauricio Hernández Sarmiento, Lina María Martínez Sánchez, Victoria Lucia Dávila Osorio, Verónica Arango Urrea, Laura Restrepo Serna, Diana Carolina Grajales Ospina, Natalia Vargas Grisales, Manuela Estrada Gómez, Johan Sebastián Lopera Valle, Andrés Eduardo Toro Montoya, Juan José García Gil, José Leonardo Domicó Domicó, Diber Lopera, Jaime Robledo. Tuberculosis in indigenous communities of Antioquia, Colombia: Epidemiology and beliefs. J Immigrant Minority Health. 2013 Feb;15(1):10-16. DOI 10.1007/s10903-012-9688-1.

Año 2012

Año 2011

  • Robledo JA, Murillo A, Rouzaud F. Physiological Role and Potential Clinical Interest of Mycobacterial Pigments. IUBMB Life. 2011;63:71-78.
  • María Alejandra Alvarez, Patricia Arbelaez, Francisco Ignacio Bastos, Ben Berkhout, Basudev Bhattacharya, Gennady Bocharov, Valery Chereshnev, Paloma Cuchí, Martin Däumer, Olga Demikhova, Knut Feldmann, Luis F. García, Claudia Giehl, Akash Gulalia, Beate Kampmann, Eduard Karamov, Poloko Kebaabetswe, Mikhail Kiselev, Anne-Laure Knellwolf, Afranio L. Kritski, Christoph Lange, Cecilio López-Galíndez, Albert Makone, Anandi Martin, Harriet Mayanja-Kizza, Ruth McNerney, Andreas Meyerhans, Giovanni Battista Migliori, Mariza G. Morgado, Jean Nachega, Bagrey Ngwira, Michal Odermarsky, Martin Ota, Juan Carlos Palomino, Gaby E. Pfyffer, Wolfgang Preiser, Viviana Ritacco, Jaime Robledo, Camilla Rodrigues, Horacio Salomón, Sofia Samper, Jorge Sanchez, Martina Sester, Pradeep Seth, Boniswa Seti, Igor Sidorovich, Rupak Singla, Laure Sonnier, Carlo Torti, Enrico Tortoli, Wim Vandevelde, Stefano Vella, Valdilea Veloso, Hagen von Briesen, Kamini Walia, Gerhard Walz, Claire Wingfield. Research  priorities for HIV/ M. tuberculosis Co-Infection. The Open Infectious Diseases Journal 03/2011; 5:14-20.

Año 2010

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