Biología Celular y Molecular

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La unidad inició su funcionamiento en el año de 1991 con la llegada a la CIB del Dr. Juan Guillermo McEwen Ochoa, MD y Ph.D en Biología Molecular del Instituto Weizmann, en Israel. El énfasis de la investigación de la unidad ha sido el estudio de la biología molecular de las micosis, en especial los aspectos genéticos, moleculares y evolutivos asociados a la Paracoccidioidomicosis (PCM), enfermedad causada por el hongo dimórfico térmico y patógeno humano Paracoccidioides brasiliensis.

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[av_tab title=’Equipo
científico‘ icon_select=’no’ icon=’ue800′ font=’entypo-fontello’ custom_id=” av_uid=’av-8xvy5′]

Orville Hernandez Ruiz Líder de unidad ohernandez@cib.org.co

Juan Gillermo McEwen Ochoa Investigador jmcewen@cib.org.co

Ana Maria García Cepero Investigadora agarcia@cib.org.co

Angela Maria López García Investigadora angie.lopez1501@gmail.com

Elizabeth Misas Rivas Investigadora elizabeth.misas@gmail.com

Oscar Mauricio Gómez Guzmán Investigador oscargomez24@hotmail.com

Jorge Alberto Osorno Upegui Investigador osornoupegui@gmail.com

Maria Camila Zuleta Estudiante mzuleta@cib.org.co

Johana Carolina Ossa Tabares Estudiante johana.ossa@udea.edu.co

Leidy Maritza Sánchez González Estudiante jmaritzasg@gmail.com

Susana Torres Morales Estudiante sutorresmo@gmail.com

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[av_tab title=’Líneas de
investigación‘ icon_select=’no’ icon=’ue800′ font=’entypo-fontello’ custom_id=” av_uid=’av-e681h’]

Biología molecular de las micosis

Énfasis en el estudio de la de los aspectos genéticos y moleculares asociados a la Paracoccidioidomicosis (PCM), enfermedad causada por el hongo Paracoccidioides brasiliensis.

Hipertensión y riesgo cardiovascular

Comienza su desarrollo bajo la dirección del Dr. Dagnovar Aristizábal Ocampo.

Bioinformática

Esta línea se centra en la aplicación de herramientas y estrategias de investigación bioinformática para el análisis de genomas de hongos y para el estudio genético de enfermedades crónicas humanas.

Microbiología y Biotecnología

Desarrollo y aplicación de técnicas microbiológicas y moleculares para la evaluación y estudio de productos y componentes activos industriales y para el desarrollo de productos biotecnológicos.
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[av_tab title=’Proyectos
biología‘ icon_select=’no’ icon=’ue800′ font=’entypo-fontello’ custom_id=” av_uid=’av-autfh’]

En ejecución

Colciencias A gene atlas for human pathogenic fungi. Colciencias Population analysis and molecular understanding of the aging diseases locus 9p21.3 in a Colombian cohort: a multi-level study. IUCMA Evaluación del silenciamiento de genes asociados en la respuesta al estrés oxidativo en Paracoccidioides brasiliensis: Efectos en el proceso infeccioso.

IUCMA Estandarización de estrategias moleculares para la evaluación de la resistencia a compuestos azólicos en diferentes especies de Candida. IUCMA Identificación de mecanismos de resistencia al fluconazol en aislamientos clínicos de Cryptococcus neoformans var. grubii aislados de pacientes colombianos VIH/Sida.

Finalizados

Colciencias Silenciamiento de los genes de adherencia y estrés oxidativo en Paracoccidioides brasiliensis (Pb): consecuencias en el proceso infeccioso. Colciencias Efecto del componente ancestral y de genes de susceptibilidad a síndrome a cardiometabólico en una muestra de población colombiana. IUCMA Implementación de técnicas de tipificación molecular para el seguimiento epidemiológico de infecciones causadas por diferentes especies de Candida en entidades hospitalarias de Medellín. Tecnoquímicas Evaluación de la actividad antimicótica del Isoconazol, Terbinafina, Fenticonazol y Nistatin contra hongos patógenos de piel.

Colciencias Genotipos y Haplotipos de los receptores Beta Adrenérgicos y determinantes del riesgo cardiovascular en una población Colombiana. Colciencias Comparative genomics and virulence in the pathogenic fungus Paracoccidioides brasiliensis. Tecnoquímicas Desarrollo y evaluación de un microorganismo genéticamente modificado para la expresión del hEGF. Tecnoquímicas Evaluación de la actividad microbiológica siete talcos para pies.

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cooperación‘ icon_select=’no’ icon=’ue800′ font=’entypo-fontello’ custom_id=” av_uid=’av-8amr9′]

• Universidad de Antioquia
• Grupo de Micología Médica Facultad de Medicina U de A (Myrtha Arango)
• Grupo GIEM (Carlos Peláez)
• Institución Universitaria Colegio Mayor de Antioquia
• Grupo de Biociencias (Clara López)
• Universidad de los Andes
• LAMFU (Silvia Restrepo / – Adriana Celis)
• University of California en Berkeley
• Broad Institute (MIT and Harvard)
• Instituto Auxologico Italiano
• Università de Milano-Bicocca
• Ohio State University
• Universidade Federal de Sao Paulo (UNIFESP)
• Universidade de Goias

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biología celular‘ icon_select=’no’ icon=’ue800′ font=’entypo-fontello’ custom_id=’#publicaciones_tab_salud’ av_uid=’av-b38o5′]

• Publicado en revista especializada: Updates and Comparative Analysis of the Mitochondrial Genomes of Paracoccidioides spp. Using Oxford Nanopore MinION Sequencing. Suiza, Frontiers in Microbiology ISSN: 1664-302X, 2020 vol:11 fasc: N/A págs: 1 – 10, DOI:10.3389/fmicb.2020.01751Autores: ELIZABETH MISAS RIVAS.
• Publicado en revista especializada: Proteome characterization of Paracoccidioides lutzii conidia by using nanoUPLC-MSE. Reino Unido, Fungal Biology ISSN: 1878-6146, 2020 vol:124 fasc: N/A págs: 766 – 780, DOI:10.1016/j.funbio.2020.05.004Autores: CELIA MARIA SOARES DE ALMEIDA, ORVILLE HERNANDEZ RUIZ, CLAYTON LUIZ BORGES.
• Publicado en revista especializada: Draft genome sequences of clinical and environmental isolates of Aspergillus tamarii from Colombia. Estados Unidos, Microbiology Resource Announcements ISSN: 2576-098X, 2020 vol:9 fasc: N/A págs: e01514-19 – e01514-19, DOI:10.1128/MRA.01514-19Autores: OSCAR MAURICIO GOMEZ GUZMAN, SUSANA TORRES MORALES, ALVARO LEON RUA GIRALDO, DIANA PATRICIA TAMAYO OSSA, JUAN GUILLERMO MCEWEN OCHOA, CLAYTON L BORGES, ORVILLE HERNANDEZ RUIZ.
• Publicado en revista especializada: Caracterización de Candida spp. aisladas a partir de urocultivos en la ciudad de Medellín. Colombia, Infectio ISSN: 0123-9392, 2020 vol:24 fasc: 4 págs: 217 – 223, DOI:Autores: ORVILLE HERNANDEZ RUIZ, CLARA DUQUE RESTREPO, DIANA MARCELA SANCHEZ, OSCAR MAURICIO GOMEZ GUZMAN, ANGELA MARIA GAVIRIA NUNEZ, ALVARO LEON RUA GIRALDO.
• Publicado en revista especializada: Capacity of Histoplasma capsulatum to survive the composting process. Applied and Environmental Soil Science ISSN: 1687-7667, 2019 vol:2019 fasc: N/A págs: 1 – 9, DOI:10.1155/2019/5038153Autores: LUISA FERNANDA GOMEZ LONDONO, JUAN GUILLERMO MCEWEN OCHOA, CARLOS ALBERTO PELAEZ JARAMILLO, ALEJANDRA ZULUAGA RODRIGUEZ, MYRTHA ARANGO, MARIA DEL PILAR JIMENEZ ALZATE.
• Publicado en revista especializada: The LUFS domain, its transcriptional regulator proteins, and drug resistance in the fungal pathogen Candida auris. Protein Science ISSN: 1469-896X, 2019 vol:28 fasc: N/A págs: 2024 – 2029, DOI:10.1002/pro.3727Autores: ELIZABETH MISAS RIVAS.
• Publicado en revista especializada: Molecular epidemiology of Colombian Histoplasma capsulatum isolates obtained from human and chicken manure samples. Heliyon ISSN: 2405-8440, 2019 vol:5 fasc: 7 págs: 1 – 8, DOI:10.1016/j.heliyon.2019.e02084.Autores: OSCAR MAURICIO GOMEZ GUZMAN.
• Publicado en revista especializada: Down-regulation of EF-Tu impairs host Cell interaction and virulence by Paracoccidioides brasiliensis. Estados Unidos, Scientific Reports ISSN: 2045-2322, 2019 vol:6 fasc: N/A págs: 17206 – 17206, DOI:10.1038/s41598-019-51540-yAutores: CAROLINE MARIA MARCOS, DIANA PATRICIA TAMAYO OSSA, ANGELA MARIA LOPEZ GARCIA, JUAN GUILLERMO MCEWEN OCHOA, ORVILLE HERNANDEZ RUIZ.
• Publicado en revista especializada: Response of Paracoccidioides lutzii to the antifungal camphene thiosemicarbazide determined by proteomic analysis. Inglaterra, Future Microbiology ISSN: 1746-0913, 2018 vol:13 fasc: 13 págs: 1473 – 1496, DOI:10.2217/fmb-2018-0176Autores: ORVILLE HERNANDEZ RUIZ, MARISTELA PEREIRA, CELIA MARIA SOARES DE ALMEIDA.
• Publicado en revista especializada: Detection of Histoplasma capsulatum in Organic Fertilizers by Hc100 Nested Polymerase Chain Reaction and Its Correlation with the Physicochemical and Microbiological Characteristics of the Samples. American Journal of Tropical Medicine and Hygiene ISSN: 0002-9637, 2018 vol:98 fasc: 5 págs: 1303 – 1312, DOI:10.4269/ajtmh.17-0214Autores: LUISA FERNANDA GOMEZ LONDONO, ISAURA PATRICIA TORRES GOMEZ, JUAN GUILLERMO MCEWEN OCHOA, MARIA DEL PILAR JIMENEZ ALZATE.
• Publicado en revista especializada: Evaluación de una técnica de PCR en tiempo real para determinar colonización por Streptococcus agalactiae en mujeres gestantes de Medellín que consultan en Dinamica IPS. Colombia, Infectio ISSN: 0123-9392, 2018 vol:22 fasc: 1 págs: 26 – 29, DOI:Autores: CLARA MARIA DUQUE, ORVILLE HERNANDEZ RUIZ, DIANA MARCELA SANCHEZ, JENNY ANDREA CARMONA VALENCIA, ANGELA MARIA GAVIRIA NUNEZ.
• Publicado en revista especializada: Molecular Epidemiology of Candida auris in Colombia Reveals a Highly Related, Countrywide Colonization With Regional Patterns in Amphotericin B Resistance. Clinical Infectious Diseases ISSN: 1058-4838, 2018 vol:68 fasc: N/A págs: 1 – 7, DOI:10.1093/cid/ciy411Autores: ELIZABETH MISAS RIVAS.
• Corto (Resumen): Draft Genome Sequences of Two Sporothrix schenckii Clinical Isolates Associated with Human Sporotrichosis in Colombia. Genome Announcements ISSN: 2169-8287, 2018 vol:6 fasc: 24 págs: e00495-18 – e00495-19, DOI:10.1128/genomeA.00495-18Autores: OSCAR MAURICIO GOMEZ GUZMAN, LAURA CAROLINA ALVAREZ ACEVEDO, JOSE FERNANDO MUNOZ GOMEZ, ELIZABETH MISAS RIVAS, JUAN ESTEBAN GALLO BONILLA, MARIA DEL PILAR JIMENEZ ALZATE, MYRTHA ARANGO, JUAN GUILLERMO MCEWEN OCHOA, ORVILLE HERNANDEZ RUIZ, OLIVER CLAY.
• Publicado en revista especializada: Genome analysis reveals evolutionary mechanisms of adaptation in systemic dimorphic fungi. Scientific Reports ISSN: 2045-2322, 2018 vol:8 fasc: 1 págs: 85 – 93, DOI:10.1038/s41598-018-22816-6Autores: JOSE FERNANDO MUNOZ GOMEZ, JUAN GUILLERMO MCEWEN OCHOA, OLIVER CLAY, CHRISTINA A CUOMO.
• Corto (Resumen): Toward Multiple SNP Motif Analyses of Loci Associated with Phenotypic Traits. Journal of the American College of Cardiology ISSN: 0735-1097, 2017 vol:70 fasc: 12 págs: 1539 – 1540, DOI:10.1016/j.jacc.2017.05.080Autores: JUAN ESTEBAN GALLO BONILLA, ELIZABETH MISAS RIVAS, JUAN GUILLERMO MCEWEN OCHOA, OLIVER CLAY.

• Tamayo D, Hernández O, Muñoz-Cadavid C, Cano LE, González A. Interaction between Paracoccidioides brasiliensis conidia and the coagulation system: Involvement of fibrinogen. Mem Inst Oswaldo Cruz. 2013;108(4):488-93.
• Tamayo D, Muñoz JF, Torres I, Almeida AJ, Restrepo A, McEwen JG, et al. Involvement of the 90kDa heat shock protein during adaptation of paracoccidioides brasiliensis to different environmental conditions. Fungal Genetics and Biology. 2013;51(1):34-41.
• Hernández O, Almeida AJ, Tamayo D, Torres I, Garcia AM, López A, et al. The hydrolase PbHAD32 participates in the adherence of paracoccidioides brasiliensis conidia to epithelial lung cells. Medical Mycology. 2012;50(5):533-7.
• Balparda JK, Gallo JA, Mcewen JG, Ochoa JE, Aristizábal D. Non-invasive hemodynamic evaluation with impedance cardiography: Applications in heart failure and hypertension. Revista Colombiana de Cardiologia. 2012;19(2):82-90.
• García Blanco S, Muñoz JF, Torres I, Díez Posada S, Gómez BL, McEwen JG, et al. Differential PbP27 expression in the yeast and mycelial forms of the paracoccidioides brasiliensis species complex. Fungal Genetics and Biology. 2011;48(12):1087-95.
• Hernández O, Tamayo D, Torres I, Restrepo Á, McEwen JG, García AM. Kinetic analysis of gene expression during mycelium to yeast transition and yeast to mycelium germination in paracoccidioides brasiliensis. Biomedica. 2011;31(4):570-9.
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• Desjardins CA, Champion MD, Holder JW, Muszewska A, Goldberg J, Bailão AM, et al. Comparative genomic analysis of human fungal pathogens causing paracoccidioidomycosis. PLoS Genetics. 2011;7(10).
• Clay OK, Bernardi G. GC3 of genes can be used as a proxy for isochore base composition: A reply to elhaik et al. Mol Biol Evol. 2011;28(1):21-3.Salgado-Salazar C, Jones LR, Restrepo Á, McEwen JG. The human fungal pathogen paracoccidioides brasiliensis (onygenales: Ajellomycetaceae) is a complex of two species: Phylogenetic evidence from five mitochondrial markers. Cladistics. 2010;26(6):613-24.
• Hernández O, Almeida AJ, Gonzalez A, Garcia AM, Tamayo D, Cano LE, et al. A 32- kilodalton hydrolase plays an important role in paracoccidioides brasiliensis adherence to host cells and influences pathogenicity. Infect Immun. 2010;78(12):5280-6.
• Torres I, García AM, Hernández O, González A, McEwen JG, Restrepo A, et al. Presence and expression of the mating type locus in paracoccidioides brasiliensis isolates. Fungal Genetics and Biology. 2010;47(4):373-80.

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