La dirección general tiene funciones científicas y administrativas entre las que se destacan:

• Orientar las políticas de investigación de la institución.
• Asesorar al comité científico y a los grupos de investigación en el desarrollo y creación de líneas de investigación, así como en la definición de su relevancia.
• Buscar redes de colaboración nacionales e internacionales.
• fortalecer los programas de formación de investigadores en la institución.
• Coordinar la evaluación de todo proyecto que busque aprobación  y aspire a financiación.
• Analizar de acuerdo a la reglamentación de la CIB, las hojas de vida de los investigadores que deseen vincularse a la institución, así como definir los logros y metas que deben lograr.
• Evaluar la gestión científica de los jefes de unidad  la producción de sus grupos de investigación de acuerdo a los parámetros que se definan.
• Establecer periódicamente estrategias que fortalezcan los programas de investigación y de formación de la CIB.